Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL9Q9P2J3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms