Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXD4L1Q9NU39 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXD4L1Q9NU39 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms