Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ASCL3Q9NQ33 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms