Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCAPERQ9BY12 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCAPERQ9BY12 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms