Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms