Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ALS2CR12Q96Q35 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ALS2CR12Q96Q35 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms