Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC97Q96F63 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms