Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1AQ96CP6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1AQ96CP6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms