Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRRC17Q8N6Y2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC17Q8N6Y2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms