Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LTBP4Q8N2S1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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