Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGD6Q6ZV73 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD6Q6ZV73 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD6Q6ZV73 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGD6Q6ZV73 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms