Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms