Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms