Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARMIL2Q6F5E8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms