Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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FAM208BQ5VWN6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAM208BQ5VWN6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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