Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCID2Q5JVF3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCID2Q5JVF3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms