Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALFQ53S48 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms