Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC153Q494R4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms