Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKIDA1Q1XH10 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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