Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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CDSNQ15517 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDSNQ15517 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDSNQ15517 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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