Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RYR3Q15413 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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