Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDCD1Q15116 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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