Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK5R1Q15078 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDK5R1Q15078 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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