Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TUBB3Q13509 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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