Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RESTQ13127 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms