Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GPS1Q13098 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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