Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CBFB-206ENST00000565389 846 ntTSL 1 (best)8.94□□□□□ -0.984e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 UBE2H-207ENST00000486283 788 ntTSL 36.46□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.88□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.074e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.254e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 PER1-205ENST00000578089 830 ntTSL 311.88□□□□□ -0.514e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 PER1-214ENST00000582719 3677 ntTSL 511.43□□□□□ -0.584e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 510.21□□□□□ -0.774e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 NDUFA10-210ENST00000471378 582 ntTSL 39.73□□□□□ -0.854e-10■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 OS9-208ENST00000546916 1028 ntTSL 220.33■□□□□ 0.855e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.345e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.555e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 28.9□□□□□ -0.985e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 ATAD2-204ENST00000521496 3133 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.869e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFA2T2-207ENST00000471007 712 ntTSL 220.84■□□□□ 0.934e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 ABCG5-203ENST00000409962 2512 ntTSL 216.55■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 ABCG5-204ENST00000486512 3033 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 DLC1-207ENST00000510250 1925 ntTSL 211.72□□□□□ -0.532e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.624e-6■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CNOT1-208ENST00000565697 385 ntTSL 39.86□□□□□ -0.832e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 49.5□□□□□ -0.892e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 47.82□□□□□ -1.162e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.362e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.652e-7■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-8■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.031e-8■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.648e-12■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.871e-323■□□□□ 10.5
ILF3Q12906 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 26.08□□□□□ -1.444e-15■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.353e-39■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 STRAP-201ENST00000025399 1442 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-39■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 STRAP-206ENST00000541731 1698 ntTSL 29.71□□□□□ -0.853e-39■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.396e-7■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 MSH5-214ENST00000468602 637 ntTSL 311.06□□□□□ -0.644e-7■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 ZNF124-205ENST00000491848 701 ntTSL 312.19□□□□□ -0.462e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 PCBP2-219ENST00000550733 754 ntTSL 28.54□□□□□ -1.047e-8■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 PCBP2-209ENST00000547048 1696 ntTSL 26.38□□□□□ -1.397e-8■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 17e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.997e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 219.84■□□□□ 0.777e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.617e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.587e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-205ENST00000419280 1212 ntTSL 517.23■□□□□ 0.357e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-214ENST00000494894 859 ntTSL 315.65■□□□□ 0.17e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.067e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 TMEM44-209ENST00000452358 846 ntTSL 314.24□□□□□ -0.137e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 PRKCSH-201ENST00000585325 598 ntTSL 413.36□□□□□ -0.271e-8■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.427e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 GPR107-207ENST00000493417 2833 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.487e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.497e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.497e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.567e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-205ENST00000502673 1000 ntTSL 511.39□□□□□ -0.597e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 PHACTR4-207ENST00000632964 1853 ntTSL 25.41□□□□□ -1.541e-8■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-206ENST00000503126 592 ntTSL 53.56□□□□□ -1.847e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-211ENST00000506298 549 ntTSL 23.49□□□□□ -1.857e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 CANX-214ENST00000508787 568 ntTSL 33.18□□□□□ -1.97e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 GPR107-206ENST00000483935 177 ntTSL 51.83□□□□□ -2.127e-6■□□□□ 10.4
ILF3Q12906 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.881e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 POLR3K-202ENST00000481810 907 ntTSL 213.04□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-13■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 POLE-213ENST00000539357 364 ntTSL 312.25□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.521e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ZC3H18-210ENST00000567085 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.42□□□□□ -0.581e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 CDYL-202ENST00000343762 3241 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.71e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ZC3H18-211ENST00000568072 444 ntTSL 34.07□□□□□ -1.761e-7■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC12.82□□□□□ -0.362e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-202ENST00000416138 552 ntTSL 419.33■□□□□ 0.681e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-211ENST00000452268 1448 ntTSL 516.77■□□□□ 0.271e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-210ENST00000451819 693 ntTSL 513.88□□□□□ -0.191e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-207ENST00000444759 2717 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-205ENST00000425656 1526 ntTSL 512.32□□□□□ -0.441e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-203ENST00000418735 594 ntTSL 412.2□□□□□ -0.461e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-209ENST00000448075 701 ntTSL 511.1□□□□□ -0.631e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-201ENST00000354204 5253 ntTSL 1 (best)10.07□□□□□ -0.81e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-204ENST00000420155 5028 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.871e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-218ENST00000487070 4937 ntTSL 1 (best)9.6□□□□□ -0.871e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-208ENST00000447759 5012 ntTSL 59.58□□□□□ -0.881e-9■□□□□ 10.3
ILF3Q12906 KANSL3-220ENST00000597150 2811 ntTSL 29.13□□□□□ -0.951e-9■□□□□ 10.3
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 110.9 ms