Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFEMP1Q12805 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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