Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBXN1Q04323 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms