Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IRF8Q02556 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms