Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTG1P63261 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms