Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GBX2P52951 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms