Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2A2P52657 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2A2P52657 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms