Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFP51858 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFP51858 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDGFP51858 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDGFP51858 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDGFP51858 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDGFP51858 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDGFP51858 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDGFP51858 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDGFP51858 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDGFP51858 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDGFP51858 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDGFP51858 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDGFP51858 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDGFP51858 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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