Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRIM1P49642 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms