Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms