Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNB1P35222 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms