Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJA4P35212 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA4P35212 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA4P35212 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms