Protein–RNA interactions for Protein: P24941

CDK2, Cyclin-dependent kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2P24941 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2P24941 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK2P24941 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK2P24941 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2P24941 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK2P24941 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms