Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTGS1P23219 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms