Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTLA4P16410 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms