Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MS4A1P11836 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MS4A1P11836 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms