Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD3O43242 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD3O43242 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms