Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CASKO14936 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CASKO14936 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms