Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VWA3AA6NCI4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VWA3AA6NCI4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms