Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms