Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms