Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms