Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CHMP5Q9NZZ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms