Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SERINC1Q9NRX5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms